Grupos protectores temporales y permanentes
En la síntesis en fase sólida hay dos tipos: el temporal, que protege el amino de la cadena y se retira en cada ciclo, y los permanentes, que protegen las cadenas laterales hasta el final. En la estrategia Fmoc/tBu, el temporal se retira con base y los permanentes con ácido, una combinación ortogonal en la que retirar uno no afecta a los otros 2.
Los grupos protectores Boc y Fmoc
La estrategia clásica con Boc (t-butiloxicarbonilo) retiraba el grupo temporal con ácido trifluoroacético y liberaba el péptido con fluoruro de hidrógeno anhidro; el ácido repetido en cada ciclo podía arrancar poco a poco las protecciones laterales. Hoy la mayoría de los péptidos sintéticos se fabrican con Fmoc, y Boc se reserva para aplicaciones especiales 2. El clivaje retira al final las protecciones permanentes.