Iones b e y en la espectrometría de masas en tándem
Roepstorff y Fohlman propusieron en 1984 la nomenclatura que todavía se usa: los fragmentos que conservan el extremo N-terminal se llaman a, b y c, y los que conservan el C-terminal, x, y y z, según el enlace que se rompe 2. Con la disociación inducida por colisión, la más común, predominan los iones b e y 1.
De los fragmentos a la secuencia
Dos iones consecutivos de la misma serie difieren en la masa de un residuo, así que la escalera de diferencias se traduce en aminoácidos; la leucina y la isoleucina pesan lo mismo y no se distinguen por esta vía 1. La lectura complementa a la LC-MS, que confirma la masa de la molécula completa, y a la HPLC, que da la pureza.
La técnica también sigue a un péptido y a sus productos de degradación: Rahaman y colaboradores cuantificaron el TB-500 y sus metabolitos, en experimentos in vitro y en ratas, con MS/MS de alta resolución 3.